膏方进补非一日之功，通常要服用较长的时间，一般以三个月左右为宜。为了使膏方能在服用期间，保质而充分发挥作用以达到滋补的目的，其存放方法，至关重要。

由于御膏房手工膏方未添加防腐剂，一般来说，保质期要短于市面上的包装成品膏方。因此，膏方的收藏和保存也是很重要的一环，如收藏不妥当，可能会发霉变质，浪费一料好膏方。

首先在膏方制作后，让其充分冷却，才可加盖。一般存放膏方的容器以瓷器、玻璃为主，切不可用金属的锅、罐存放，以免引起化学反应。

好的膏方不容易变质，但因多数膏方糖分含量高，且有如膏、鹿胶等含动物蛋白的荤类材料，温度、湿度过高还是很容易变质发霉，所以放置的环境以阴凉干燥为好。如遇到气温连升、或梅雨天气，膏方受热受潮，可隔水高温蒸烊，启盖待完全冷却后再将盖子盖好，防止水蒸气落在膏面上产生霉点，影响存放。

现代人家里有冰箱，也可以将膏方存放于冰箱内。冰箱需时常清理、保持卫生，以免滋生细菌。膏方与肉、果、菜等物分开存放，以免互相影响。

服用膏方切记吃吃停停，否则就不可以达到滋补目的，浪费食材。因此膏方放置的位置应能时常看见，避免因为“藏得太深”的缘故而忘记服用。

多份膏方分装，应当吃完一份再开另一份。盛取膏方应有一个专用、干净、干燥的汤匙。也可取3-5天服用量放入小的分装瓶或其他容器内，避免多次取用的污染。