对照新版GSP要求，不少连锁药店经营者大感头疼：执业药师数量不足，药店无法扩张。不少连锁药店企业因此减缓了门店的扩张速度;而硬件方面的提升对于资金雄厚的连锁药店来说影响甚小，甚至早在新版GSP发布之前，不少连锁药店就已经配备甚至超出相关设施要求。但同样的要求，单体药店面临的困难更大。也因此在新版GSP推出之初，就有业内人士预言，到2016年将有80%的单体药店被淘汰。
从目前我国药品零售市场的发展情况看，单体药店仍占较大比例。据估算，目前单体药店数量占我国药店门店总数的2/3，按目前我国拥有药店43万家左右计算，单体药店数量近28万家。
尽管有不少业内人士认为，单体药店的减少、加盟药店数量的提高对于我国药品零售行业的发展将起到积极的作用，但也有人指出，单体药店是药品零售行业不可或缺的组成部分，尤其是在部分连锁企业无法延伸到的乡村以及城乡结合部等地区，单体药店的重要性不可或缺。
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