辉瑞公司创立于1849年，早期的辉瑞公司是一家以生产化工产品为主要经营业务的化学品公司，药物作为化学品的一种也属于公司的经营范围之内。1861年爆发的南北战争给了辉瑞公司发展的机会，战争中辉瑞向北军提供了大量的药品，公司随着战争的进展而迅速发展，成为美国国内较大的化学品生产企业之一。 　　南北战争之后辉瑞的主要产品是柠檬酸，直到1928年弗莱明爵士发现后，辉瑞公司开始介入的生产，并逐渐将企业的重心转移到领域，此后，辉瑞公司对发酵工艺进行了深入研究，并将其用于柠檬酸和的生产，现在工业界普遍认同辉瑞公司是发展发酵技术的先驱之一。 　　第二次世界大战给了辉瑞公司又一次发展的机会，辉瑞公司是当时单独使用发酵技术生产的企业，不仅产量极大且生产成本非常低，向美国军方提供了大量相对廉价的产品，公司也利用这一机会飞速扩张。 　　战后的辉瑞公司进一步加强了药物的生产与研发，并于1951年研发广谱土霉素成功。此后的四环素、吡罗昔康等药物的成功研发都给辉瑞带来了巨大的经济利益。这些药物很多成为临床的经典药物，而辉瑞的很多研发案例也因而成为药物设计的经典案例。 　　1998年，辉瑞公司研发的西地那非(万艾可)上市，并且获得成功，据统计在全世界，每秒钟就有四粒"万艾可"被患者服用，辉瑞公司也因为万艾可在商业上的巨大成功先后吞并了华纳兰伯特公司和法玛西亚公司，成为美国很大的药品生产企业。其众多的产品组合、科研开发项目、成熟的非处 　　方药业务，将使新辉瑞公司成为强大的具有竞争力的跨国医药公司。 　　2009年，已成为全球很大药品制造商的辉瑞制药与竞争对手惠氏宣布，两家公司已确定达成并购协议，辉瑞将按惠氏当前50.19美元的股价对后者以现金加换股方式进行收购，总价值大约680亿美元。收购完成后，辉瑞公司全球很大药品制造商的地位将进一步得以巩固。 　　2009年10月16日辉瑞公司宣布，已正式完成对惠氏公司的收购。随着近日美国和加拿大两国政府审批辉瑞收购惠氏案，这桩十年来制药界很大并购案终于尘埃落定，如今辉瑞收购惠氏案已获所有。