从净水器发源伊始，滤芯便是其重要的一个部件，而早的滤芯便是滤瓶式结构。净水器的净化技术发展日新月异，但滤芯技术的革新却较为缓慢，目前公认的主要有三种滤芯。
　　优先种为早出现的滤瓶式滤芯，是指将活性炭、PP棉等滤料放置在瓶中，再用专业工具安装在净水器上。滤瓶式滤芯具有制造和更换成本低、过滤流量大、使用时间久的有点，但同时也存在更换麻烦(需要专业人员、专业工具)、二次污染(滤瓶仅用水冲洗、更换时会接触滤料)等缺点。目前，滤瓶式滤芯仅在外壳材质上有所改变，大多数企业依旧采用塑料材质，少部分的企业采用透明树脂材质或不锈钢材质。目前，为主流的滤芯依旧是滤瓶式，如安吉尔、沁园等大多数企业的RO机和超滤机均是采用滤瓶式。随着各主流品牌对滤芯的不断升级，采用不同滤芯也成为了净水器企业用来区隔中高低端产品的方式。
　　第二种为快插式滤芯，也可称为快接式滤芯，由于早是来自韩国的舶来品，所以偶尔业内也称其为韩式快插式滤芯。它的一大突出特点便是将滤瓶式滤芯从敞开式变成了封闭式，在滤芯维护上也成为了真正的更换滤芯，更换时需要将整个滤瓶直接拆下抛弃，而不是像滤瓶式那样更换的只是其中的滤料，更换人员也无法直接接触到滤料，从而起到了避免二次污染的感觉。当然，也正是因为比滤瓶式滤芯多更换一个外壳，所以无论从制造成本还是滤芯价格来看，快插式滤芯要远高于滤瓶式滤芯。此外，从体积上来看，快插式滤芯的体积约为滤瓶式滤芯的四分之一，所以在过滤流量上较传统滤瓶式滤芯要小。但快插式滤芯也有不成熟的地方，其滤芯更换依旧需要专业人员和专业工具。此外，由于快插式滤芯接口较多，且技术不够稳定，所以造成的漏水事故也屡见不鲜。目前，行业内美的、沁园、安吉尔等众多国内品牌均有采用快插式滤芯的净水器在销售，且大多是作为高端机型出现。
　　第三种为卡接式滤芯。2013年4月，美的推出了采用ONE-TOUCH一体式滤芯(卡接式滤芯)的厨房净水器。和普通滤芯不同的是，卡接式滤芯采用一体式设计，滤芯完全密封，更换滤芯时，只需轻松旋转，便可实现换芯。早在美的之前，业内便有一些企业已采用卡接式滤芯，如九阳、台湾金地源等。由于受生产技术条件制约，卡接式滤芯在业内并没有能够大范围推广，而其体积相对于滤瓶式滤芯要小很多，使用周期短的缺点使得卡接式滤芯很难受到消费者和经销商的亲睐。但不可否认的是，卡接式滤芯兼具了韩式快插式滤芯无二次污染问题的同时，还具备了无需专业人员专业工具安装的优势，消费者将滤芯买回家后，可自行拆装更换滤芯，非常简易和便捷，大大降低了售后成本，且滤芯的独特性使得经销商可销售滤芯实现二次赢利。目前，随着美的等更多知名品牌加入到卡接式滤芯的阵营，诸如奔泰等品牌也将卡接式滤芯进行了再次改良，增大了其体积，延长了使用周期。卡接式滤芯将会是未来净水器滤芯的发展趋势。