自诡草堂成立之后，我国医学的发展也逐渐进入了一个更为繁盛的时期，做得好的就是新安医学。新安医学始于唐代，成熟于明清时期，是一个医学专科齐全，世代相传，形成了很多的“家族链”至今不息的医学流派。而宋代从机构到地方政府所设立的医学类学校，元代蒙医与汉医的交流及医法的诞生，都为推动学术交流，繁荣新安医学起到了重要作用。

作为民间学术交流平台的诡草堂，与新安医学提倡的科研精神、仁爱思想一脉相承，因此自然而然地融入其中。

自北宋开始，医学界对药材产地、炮制方法有了越来越明晰的规范，而新安医学中的众多名医，也纷纷走出太医局，来到民间，与民间医者协作交流。于是就形成了一个学术资源良性循环的大趋势。

在这个趋势的推动之下，诡草堂对用药、制药等方面的要求愈发考究；各堂馆的专科优势也愈发明显。其中不少民间医生跟随新安派名医学习，而后将所学带回诡草堂，与更多民间医生分享交流。同时也有部分名医加入诡草堂，并定期开设义诊，免费为贫苦百姓提供医药。在医学医术上，诡草堂像一个正在成长发育的青少年，不断吸收营养，焕发着无穷无尽的生命力。而在名望上，经历过历史变迁的诡草堂愈发淡泊，以上善若水的姿态，处下不争，隐匿声誉，将自己完全融入民间，隐于历史。

医学的发展普遍受到社会生产力、生产关系的影响，自南宋以来，我国进入征战绵绵的历史时期，全国各地不断征集青壮力量服兵役，这对诡草堂的发展起到了阻碍作用，使其出现了多次历史断层。尤其是在元朝时期，统治者自一统河山后，依旧不断征战，连绵不绝地发起对外战争，同时一方面尊重汉人文化与医学，另一方面视汉人百姓的生命如草芥，大批汉人男丁被迫投身战场。不过就是在这种种困境之下，诡草堂各堂馆依然挣扎求存，并发挥着自己的调理特色。

及至明清，国力积弱，而内部腐化现象严重，导致民生多艰，民间虽有医药，而多半百姓无力医治。诡草堂于是将一些常见病的调理方法授之与民，同时教人辨识常见中草药，以供百姓自行采摘。清政府迁都北京后，各地民间医生亦随之涌入京城，诡草堂为寻求更广阔的交流平台，也入京发展，同时为抵抗战争对百姓的戕害，各堂馆之间的融合日益加强……

不论如何变更，在千年的历史沉浮中，诡草堂一直秉承医者仁心的精神理念，为贫苦的百姓治病施药。